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文獻(xiàn)參考和實(shí)習(xí)報(bào)告
想在貴公司合成miRNA或mRNA FISH探針,需要提供那些信息?
需要提供的信息:① 種屬(Human, Mouse, Rat, Rabbit等);② 基因名稱,未知的基因需要提供序列;
mRNA或miRNA探針的價(jià)格是多少,能檢測(cè)多少片子,標(biāo)記探針的周期?都包括那些內(nèi)容,是否包含陰性對(duì)照、FISH雜交液等輔助組分?
mRNA或miRNA探針價(jià)格2800元,體積是50μl,和雜交液按1:50-100稀釋,能檢測(cè)100-200張片子。 mRNA或miRNA探針的備貨周期,自客戶確認(rèn)下訂單日起計(jì),2周內(nèi)發(fā)貨。 mRNA或miRNA包括了1ml FISH RNA 雜交液、1ml DAPI-抗熒光淬滅封片劑、50μl陰性對(duì)照或陽(yáng)性對(duì)照探針(陰性、陽(yáng)性對(duì)照只能選一種)。
貴公司合成的mRNA探針,是cDNA探針,還是cRNA探針,長(zhǎng)度大概多少?
我們合成的mRNA探針屬于cRNA探針,長(zhǎng)度40-600bp。
檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)收費(fèi);檢測(cè)沒(méi)有結(jié)果,如何收費(fèi)?
miRNA和mRNA的檢測(cè)費(fèi)用相同: 每個(gè)標(biāo)本1800元/標(biāo)本,不包含目的探針的費(fèi)用,但包含對(duì)照U6 (miRNA) 或GAPDH (mRNA)的內(nèi)參探針費(fèi)用和檢測(cè)費(fèi)用,拍照及結(jié)果統(tǒng)計(jì)。 如果陽(yáng)性對(duì)照有結(jié)果,無(wú)論miRNA或mRNA是否有結(jié)果,均正常收費(fèi),如果對(duì)照U6沒(méi)有結(jié)果,不收檢測(cè)費(fèi)。
DNA FISH探針收費(fèi),如何保證質(zhì)量?
每個(gè)目的基因探針3600元,15T,對(duì)照探針3600元,15T,贈(zèng)送DAPI-抗熒光淬滅封片劑(封片的同時(shí),減緩熒光淬滅),另本公司還提供專門針對(duì)DNA FISH的檢測(cè)試劑盒。 探針標(biāo)記之后,我們都會(huì)進(jìn)行中期染色體質(zhì)檢,質(zhì)量過(guò)關(guān)才發(fā)貨。
檢測(cè)miRNA或mRNA標(biāo)本的收集、處理與保存
石蠟切片:石蠟塊或石蠟切片保存時(shí)間不超過(guò)5年的標(biāo)本可以檢測(cè)miRNA,不超過(guò)半年的標(biāo)本可以檢測(cè)mRNA。 收集標(biāo)本后,請(qǐng)立即用10%中性福爾馬林浸泡,固定24小時(shí)后,石蠟包埋切片。收集到標(biāo)本后,最好立即固定,然后切片,不要將標(biāo)本儲(chǔ)存在-80℃,-80℃儲(chǔ)存后影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。 冰凍切片:取標(biāo)本后,立即-80℃冰凍,如果不能馬上切片,-80℃保存,干冰運(yùn)輸。冰凍切片保存時(shí)間不超過(guò)2年的標(biāo)本可以檢測(cè)miRNA 或mRNA。
如何用FISH定位某個(gè)基因?
例如:需要檢測(cè)兩個(gè)目的基因,例如MLAA-34及MLAA-22,能用FISH做這個(gè)兩個(gè)基因的染色體定位嗎?如果是檢測(cè)這兩個(gè)基因在哪幾號(hào)染色體的哪個(gè)區(qū)段,2個(gè)(探針)混合在一起檢測(cè),能達(dá)到效果嗎? 對(duì)于已知基因,想定位某個(gè)基因在哪幾號(hào)染色體上,通過(guò)“目的基因探針和染色體對(duì)照探針”結(jié)合起來(lái),才能實(shí)現(xiàn),單純地用使用某個(gè)目的基因探針,是不能定位的。 對(duì)于未知基因,由于不知道使用哪個(gè)染色體的對(duì)照探針,所以只能靠Gimsa染色后,再做FISH。“Gimsa+FISH”檢測(cè)周期至少1個(gè)月。
想針對(duì)一個(gè)1000bp左右的片段設(shè)計(jì)DNA探針,單拷貝的,可行嗎?
片段比較小,直接熒光標(biāo)記(FITC,Texas Red、Rhodamin)探針很難檢測(cè)出來(lái)。可以用地高辛標(biāo)記的探針,熒光信息放大系統(tǒng)(ABC或TSA放大系統(tǒng) )嘗試一下,但是不保證能檢測(cè)到,文獻(xiàn)報(bào)道過(guò)檢測(cè)到的最短的片段是780bp。
探針的用量是否與涂片的濃度有關(guān)?比如,一張玻片上一千個(gè)細(xì)胞,另一張是一百個(gè)細(xì)胞,探針用量一樣嗎?
與細(xì)胞數(shù)量的關(guān)系不大,一般20mm×20mm玻片面積(蓋玻片),5-10μl探針已經(jīng)足夠。 探針的用量一般取決于標(biāo)本面積的大小和所使用的蓋玻片的大小,使用20mm×20mm的蓋玻片,加5-10μl探針,使用20mm×40mm的蓋玻片,加10-20μl探針。
檢測(cè)某個(gè)融合基因,熒光定量或FISH方法,哪種好一點(diǎn)。
如果是已知的位點(diǎn),可以做RT-PCR;如果是未知位點(diǎn),則要用FISH檢測(cè); RT-PCR檢測(cè)的費(fèi)用較低,F(xiàn)ISH費(fèi)用比較昂貴。
貴公司生物的DNA FISH探針對(duì)標(biāo)本有什么要求,制備好中期染色體涂片的R顯帶可以嗎?到時(shí)可不可以一起雜交?
我們公司生產(chǎn)的探針適用于中期染色體滴片、細(xì)胞爬片、石蠟切片、可以R顯帶,但是R顯帶制備比較難,制備G顯帶的多一些(G顯帶每標(biāo)本1000元)。但是R帶與FISH結(jié)合的概率很小,所以做起來(lái)有一定的難度。
檢測(cè)某基因的拷貝數(shù),是不是只能通過(guò)FISH檢測(cè),RT-PCR能檢測(cè)嗎?
RT-PCR不能檢測(cè)某基因的拷貝數(shù)或者是否擴(kuò)增,它檢測(cè)的是基因表達(dá)的相對(duì)高低。 檢測(cè)某個(gè)基因的拷貝數(shù),只能通過(guò)FISH檢測(cè)。
細(xì)胞本身帶GFP綠色熒光,使用地高辛標(biāo)記miRNA的探針,抗地高辛的羅丹明熒光二抗,還有DAPI,細(xì)胞本身帶GFP綠色熒光會(huì)不會(huì)對(duì)熒光二抗和DAPI的顯色產(chǎn)生影響?
不會(huì)影響熒光二抗和DAPI的顯色(DAPI是藍(lán)色,GFP是綠色,羅丹明熒光二抗是紅色的),但是容易串色。
觀察DAPI的熒光應(yīng)使用哪種濾光片,會(huì)不會(huì)和GFP重疊?
觀察DAPI應(yīng)該使用紫外濾光片或者波長(zhǎng)在300~400nm的都可以(激發(fā)波長(zhǎng)和發(fā)射波長(zhǎng)),一般熒光顯微鏡都有。 有可能串色,但是影響不大。我們實(shí)驗(yàn)室曾做過(guò),細(xì)胞自身帶GFP綠色熒光和紅色熒光的FISH。
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